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Selon [[Fox News]], le virus aurait pu s'être échappé par accident de l'[[Institut de virologie de Wuhan]]. L'hypothèse est évoquée par [[Mike Pompeo]], [[secrétaire d'État des États-Unis]] citant une enquête en cours de leur administration, ce que confirme le président [[Donald Trump]]<ref name="Enquête">{{Lien web |auteur=L'Obs avec AFP |titre=L’administration Drumpf dit enquêter pour savoir si le coronavirus provient d’un laboratoire de Wuhan |url=https://www.nouvelobs.com/coronavirus-de-wuhan/20200416.OBS27623/l-administration-drumpf-dit-enqueter-pour-savoir-si-le-coronavirus-provient-d-un-laboratoire-de-wuhan.html |date=16 avril 2020 |site=nouvelobs.com |consulté le= 16 avril 2020}}.</ref>. {{lien|trad=Richard H. Ebright|fr=Richard Ebright}}, expert américain en biosécurité, estime que « les preuves laissent une base pour exclure que le Covid-19 [sic] soit une construction de laboratoire, mais aucune base pour exclure un accident »<ref>[https://www.sudinfo.be/id178069/article/2020-04-06/coronavirus-il-nest-pas-exclu-que-le-covid-19-se-soit-propage-aux-humains-apres sudinfo.be]</ref>.

[[Luc Montagnier]], co-découvreur du [[Virus de l'immunodéficience humaine|VIH]], émet l'hypothèse selon laquelle le SARS-CoV-2 serait issu d'une manipulation génétique ayant adjoint des morceaux de génome du VIH. Il reprend ainsi à son compte une étude indienne déjugée<ref name="ThèseTrèsContestée">{{Lien web |auteur=William Audureau |titre=Le coronavirus, fabriqué à partir du virus du sida ? La thèse très contestée du professeur Montagnier |url=https://www.lemonde.fr/les-decodeurs/article/2020/04/17/le-coronavirus-fabrique-a-partir-du-virus-du-sida-la-these-tres-contestee-du-pr-luc-montagnier_6036972_4355770.html |date=17 avril 2020 |site=lemonde.fr |consulté le= 18 avril 2020}}.</ref>. Cette hypothèse est hautement improbable et marginale au sein de la communauté scientifique<ref name="ThèseTrèsContestée"/>{{,}}<ref>{{Lien web|auteur=Le point|titre=En liant coronavirus et VIH, le professeur Montagnier fait polémique|jour=17|mois=avril|année=2020|url=https://www.lepoint.fr/sante/en-liant-coronavirus-et-vih-le-professeur-montagnier-fait-polemique-17-04-2020-2371881_40.php|site=lepoint.fr|consulté le=17 avril 2020}}.</ref>. Cependant la thèse d'un virus artificiel créé en laboratoire a été également avancée par un autre prix nobel; [[Tasuku Honjo]]<ref>{{Lien web |langue=fr |prénom=Florian |nom=Gouthière |titre=Le Prix Nobel Tasuku Honjo a-t-il affirmé que le coronavirus avait été créé par l’homme ? |url=https://www.liberation.fr/checknews/2020/04/27/le-prix-nobel-tasuku-honjo-a-t-il-affirme-que-le-coronavirus-avait-ete-cree-par-l-homme_1786549 |site=Libération.fr |date=2020-04-27 |consulté le=2020-07-30}}</ref>.

Selon une analyse publiée, le 17 mars 2020, dans la revue ''[[Nature (revue)|Nature]]'', par un groupe de cinq chercheurs de nationalités diverses (États-Unis, Royaume-Uni, Australie), le SARS-CoV-2 ne serait pas une construction de laboratoire ni un virus délibérément manipulé : {{citation|Bien que les preuves montrent que le SARS-CoV-2 n'est pas un virus délibérément manipulé, il est actuellement impossible de prouver ou de réfuter les autres théories de son origine décrites ici. Cependant, puisque nous avons observé toutes les caractéristiques notables du SARS-CoV-2, […] dans les coronavirus apparentés dans la nature, nous ne pensons pas qu'un type de scénario en laboratoire soit plausible<ref name="proximal origin">{{article|langue=en|url=https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9#citeas|titre=The proximal origin of SARS-CoV-2|auteur=Kristian G. Andersen, Andrew Rambaut, W. Ian Lipkin, Edward C. Holmes et Robert F. Garry |périodique=nature medecine|numéro=26|passage=450-452|date=17 mars 2020|consulté le=18 avril 2020|citation=Although the evidence shows that SARS-CoV-2 is not a purposefully manipulated virus, it is currently impossible to prove or disprove the other theories of its origin described here. However, since we observed all notable SARS-CoV-2 features, […] in related coronaviruses in nature, we do not believe that any type of laboratory-based scenario is plausible.}}.</ref>}}.