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=== Les communications à l'Académie ===
La « classe de physique » de l'Académie qui était en chargechargée de la physique, de la chimie, médecine et botanique formait un groupe de travail se réunissant toutes les semaines. Durant les premières années, du Clos domine l'agenda de recherche de ce groupe, en présentant des communications sur les principes des mixtes, la théorie de la matière, l'analyse chimique, des études sur les eaux minérales et la botanique<ref name=victor/>. Très pédagogue avec ses confrères qui l'écoutent, il s'efforce d'exposer les principes de la chimie et de reposer les bases de la chimie, en partant en particulier des écrits récents de [[Robert Boyle]]. Il s'interroge avec ses pairs sur la théorie des éléments et sur l'intérêt d'introduire des mécanismes en chimie. En mars 1667, il lit et commente l'ouvrage de Boyle, ''The origin of Forms and Qualities'' (de 1666). Le septembre 1668 à février 1669, la séance hebdomadaire du samedi à l'Académie est consacrée à la lecture de ''Certain Physiological Essays'' (paru en 1661) de Boyle, dans sa traduction latine ''Tentamina Chimica'' (de 1667).
Samuel du Clos qui avait vécu dans sa jeunesse les conflits entre les médecins paracelsiens et les médecins de la [[Faculté de médecine de Paris|Faculté]]<ref name=kahn>{{Ouvrage
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