FTO (gène)


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gène de l'espèce Homo sapiens

Le FTO (pour « Fat mass and obesity-associated protein ») est un gène situé sur le chromosome 16 humain et dont certains variants sont associés avec une obésité.

FTO
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

3LFM, 4IDZ, 4IE0, 4IE4, 4IE5, 4IE6, 4IE7, 4CXW, 4CXX, 4CXY, 4QHO, 4QKN, 4ZS3, 4ZS2

Identifiants
AliasesFTO
IDs externesOMIM: 610966 MGI: 1347093 HomoloGene: 8053 GeneCards: FTO
Position du gène (Homme)
Chromosome 16 humain
Chr.Chromosome 16 humain[1]

Chromosome 16 humain

Localisation génomique pour FTO

Localisation génomique pour FTO

Locus16q12.2Début53,701,692 bp[1]
Fin54,158,512 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 8 (souris)
Chr.Chromosome 8 (souris)[2]

Chromosome 8 (souris)

Localisation génomique pour FTO

Localisation génomique pour FTO

Locus8 C5|8 44.34 cMDébut92,040,153 bp[2]
Fin92,395,067 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • cellule épithéliale bronchiale

  • Brodmann area 10

  • gyrus frontal moyen

  • frontal pole

  • Pars compacta

  • corps calleux

  • dorsal motor nucleus of vagus nerve

  • canal galactophore

  • inferior olivary nucleus

  • Brodmann area 46
Fortement exprimé dans
  • tubercule génital

  • Aire tegmentale ventrale

  • colliculus supérieur

  • dorsal tegmental nucleus

  • dorsomedial hypothalamic nucleus

  • habenula

  • pontine nuclei

  • tail of embryo

  • Subiculum

  • colliculus inférieur
Plus de données d'expression de référence
BioGPS

Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
Composant cellulaire
Processus biologique
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

79068

26383

Ensembl

ENSG00000140718

ENSMUSG00000055932

UniProt

Q9C0B1

Q8BGW1

RefSeq (mRNA)

NM_001080432

NM_011936

RefSeq (protéine)
NP_001073901
NP_001350820
NP_001350823
NP_001350825
NP_001350826

NP_001350827
NP_001350828
NP_001350829
NP_001350830
NP_001350832
NP_001350834
NP_001350917

NP_036066

Localisation (UCSC)Chr 16: 53.7 – 54.16 MbChr 8: 92.04 – 92.4 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Un variant correspondant, sous forme homozygote, à 16 % de la population, est corrélé avec un poids augmenté et à risque majoré d'obésité, débutant dès l'enfance[5]. L'inactivation du gène, sur un modèle animal, semble protéger contre le surpoids[6]. Le mécanisme de cet effet n'est pas clair et pourrait faire intervenir l'expression de l'IRX3[7], du RBL2[8] ainsi que du SOX4 et du HHEX, les deux derniers intervenant dans la régulation de la sécrétion d'insuline[9]. Il jouerait également sur la régulation de la thermogenèse par les adipocytes[10].

L'ajout de ce gène dans les plants de pomme de terre ou de riz leur a permis de développer des racines plus longes, une photosynthèse plus efficace et une résistance à la sècheresse accrue[11].

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000140718 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000055932 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Frayling TM, Timpson NJ, Weedon MN et al. A common variant in the FTO gene is associated with body mass index and predisposes to childhood and adult obesity, Science, 2007;316:889-894
  6. Fischer J, Koch L, Emmerling C et al. Inactivation of the Fto gene protects from obesity, Nature, 2009;458:894-898
  7. Smemo S, Tena JJ, Kim KH et al. Obesity-associated variants within FTO form long-range functional connections with IRX3, Nature, 2014;507:371-375
  8. Jowett JB, Curran JE, Johnson MP et al. Genetic variation at the FTO locus influences RBL2 gene expression, Diabetes, 2010;59:726-732
  9. Ragvin A, Moro E, Fredman D et al. Long-range gene regulation links genomic type 2 diabetes and obesity risk regions to HHEX, SOX4, and IRX3, Proc Natl Acad Sci U S A, 2010;107:775-780
  10. Claussnitzer M, Dankel SN, Kim KH et al. FTO obesity variant circuitry and adipocyte browning in humans, N Engl J Med, 2015;373:895-907
  11. Céline Deluzarche, « Ajouter un gène humain aux plantes dope leur rendement de 50 % », sur Futura (consulté le )